Échantillonnage [DMV]

Gestion des échantillons

Acheminer les échantillons au laboratoire

• Le plus rapidement possible (éviter les prélèvements le vendredi)
• Utiliser des milieux de transport
  • Bactériologie : Milieu de transport pour culture bactérienne
  • Virologie : tubes secs ou milieux de transports spécifiques pour technique PCR, les milieux de transport gélosés sont à proscrire
  • Sérologie : tube sec
  • Cytologie : EDTA

Réfrigérer l’échantillon

Spécifier les analyses demandées, valider si offertes par le laboratoire (appeler!)

• Recherche par PCR ou qPCR (existence de profil respiratoire qPCR, recherche de virus et bactéries, dans certains laboratoires diagnostiques)
• Possibilité de détection des antigènes dans les tissus pour des virus et des bactéries
• Culture virale : selon les régions et laboratoires, cette technique peut ne pas être disponible
• Culture bactériologique
  • Culture de routine : M. haemolytica, P. multocida, T. pyogenes
  • Culture spécifique H. somni (NB : H. somni peut également être cultivé sur des milieux de culture de routine)
  • Culture spécifique mycoplasme avec identification Culture anaérobie
  • Antibiogramme (voir onglet suivant pour les limitations et précautions à prendre)
• Cytologie du lavage trans-trachéal ou broncho-alvéolaire
  • Cellules inflammatoires :
    • Neutrophiles dégénérés, changement toxique et bactéries intracellulaires
    • ≤ 60% macrophages et ≥ 40% neutrophiles : foyer inflammatoire
    • Elle permet également de savoir si le prélèvement a été contaminé par les VRS ou du contenu digestif (présence de débris, ou cellule compatibles avec VRS ou contenu digestif).
  • Sérologie
    • 2 prélèvements à 15-21 jours d’intervalle
    • Idéalement, les analyses des 2 prélèvements doivent être effectuées au même moment
    • Favoriser des sérologies quantitatives (ex. : SN) à des sérologies semi-quantitatives (ex : ELISA).
    • Disponible pour certains virus et certaines bactéries selon les régions et les laboratoires (ex. : BVD, IBR, BRSV, PI-3, M. bovis et H. somni)

Avantages et désavantages des différents tests diagnostics

Cliquer pour ouvrir le tableau : Avantages et désavantages des différents tests diagnostics

Pertinence de l’antibiogramme

• Il existe actuellement des seuils d’interprétation spécifiques aux bovins pour classifier les souches comme sensible, intermédiaire ou résistante et prédire la réponse clinique uniquement pour M. haemolytica, P. multocida et H.somni. et pour certains antibiotiques homologués chez les bovins;
  • Il n’est pas recommandé d’utiliser les valeurs seuils de bactéries pathogènes provenant d’autres espèces animales ou de l’homme
  • Il n’est pas recommandé d’extrapoler les valeurs seuils connues pour ces 3 bactéries à d’autres bactéries (ex. utiliser les valeurs de P. multocida pour déterminer les valeurs seuils de M. bovis)
• Le résultat est souvent obtenu plusieurs jours après le prélèvement et donc après la mise en place d’une antibiothérapie de première intention
• Utile néanmoins pour réajuster traitement si non réponse au traitement de première intention partir des résultats du prélèvement initial
• Utile pour le suivi de la sensibilité antimicrobienne de bactérie
  • Groupe d’individus
  • Évolution dans le temps
  • Aide pour le choix des antibiotiques de première ligne à privilégier dans les protocoles de traitement